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SNP 基因型检测- 小麦90K 芯片检测


Wheat90K芯片由illumina公司与E. Akhunov(KSU)、M. Hayden (DPI Victoria,Australia)以及C. Cavanagh(CSIRO,Australia)等多家机构合作完成的联盟芯片,包含美国澳大利亚合作项目中的50,000个SNP位点、英国SNP项目的12,000个SNP位点、美国NSF小麦SNP项目的800个SNP位点、法国科学家提供的保守同源基因的5,000个SNP位点、意大利科学家提供的T. durum中的2,000~3,000个SNP位点、美国科学家提供的Aegilops tauschii中的5,000个SNP位点、澳大利亚科学家提供的1,000个第7染色体的SNP位点以及1,000个TraitGenetics GmbH提供的SNP位点等。


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24制式的芯片图片(小麦90K24制式芯片)

技术特点


小麦90K芯片的特点如下:

1.位点数/样本:81,587

2.芯片规格:24样本/芯片

3.数据检出率:97%

4.81,587个SNP中,46,977个SNP在小麦的21条染色体上有遗传学或物理图谱的映射(见下表)


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技术流程


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项目周期


由于芯片是24制式的,需要满足24样品才能起始实验,环亚娱乐标记从收到样本到完成客户所需的分析需要一个月左右,如果客户需要定制化服务则可能需要更长的时间。


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